Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PudpQ9D5U5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms