Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms