Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms