Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms