Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm3404Q9D506 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm3404Q9D506 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm3404Q9D506 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm3404Q9D506 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm3404Q9D506 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm3404Q9D506 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3404Q9D506 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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