Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms