Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms