Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasgef1cQ9D300 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms