Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms