Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trappc6bQ9D289 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trappc6bQ9D289 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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