Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spns3Q9D232 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms