Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms