Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms