Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mms19Q9D071 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mms19Q9D071 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mms19Q9D071 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mms19Q9D071 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mms19Q9D071 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mms19Q9D071 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mms19Q9D071 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mms19Q9D071 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mms19Q9D071 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mms19Q9D071 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms