Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms