Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms