Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms