Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms