Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx7Q9CY18 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx7Q9CY18 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms