Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms