Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms