Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms