Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ddx28Q9CWT6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ddx28Q9CWT6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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