Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BccipQ9CWI3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BccipQ9CWI3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BccipQ9CWI3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BccipQ9CWI3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms