Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms