Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atxn3Q9CVD2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn3Q9CVD2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms