Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms