Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms