Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms