Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN1

Trap1, Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trap1Q9CQN1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trap1Q9CQN1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trap1Q9CQN1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trap1Q9CQN1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trap1Q9CQN1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trap1Q9CQN1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trap1Q9CQN1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trap1Q9CQN1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trap1Q9CQN1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trap1Q9CQN1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trap1Q9CQN1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trap1Q9CQN1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Trap1Q9CQN1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trap1Q9CQN1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms