Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Mrpl35Q9CQL6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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