Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms