Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms