Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms