Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQC3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms