Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc198Q9CPZ1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms