Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms