Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prpf8Q99PV0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms