Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms