Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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