Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
GpnmbQ99P91 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GpnmbQ99P91 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms