Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms