Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ms4a4dQ99N05 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms