Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms