Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SncaipQ99ME3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms