Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms