Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms