Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnpo2Q99LG2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms