Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmp1Q99KU0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms