Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PpifQ99KR7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms